| 州 | 都市 | 空港名(日本語 / 英語) | ICAO | IATA | 定期便 |
| 中央エクアトリア州 | ジュバ(首都) | ジュバ空港 / Juba Airport | HSSJ | JUB | あり |
| イェイ | イェイ空港 / Yei Airport | HSYE | --- | なし |
| カゴ・カジュ | カゴ・カジュ空港 / Kago Kaju Airport | HSKJ | --- | なし |
| 上ナイル州 | マラカル | マラカル空港 / Malakal Airport | HSSM | MAK | あり |
| レンク | レンク空港 / Renk Airport | HSRN | --- | なし |
| ジョングレイ州 | ボー | ボー空港 / Bor Airport | HSBR | --- | なし |
| アコボ | アコボ空港 / Akobo Airport | HSAK | --- | なし |
| ピボール | ピボール空港 / Pibor Airport | HSPI | --- | なし |
| ポチャッラ | ポチャッラ空港 / Pochalla Airport | HSPA | --- | なし |
| ユニティ州 | ベンティーウ | ベンティーウ空港 / Bentiu Airport | HSBT | --- | なし |
| ドゥアール | タール・ジャス飛行場 / Thar Jath Airstrip | ---- | --- | なし |
| レイク州 | ルンベク | ルンベク空港 / Rumbek Airport | HSMK | RBX | なし |
| イロル | イロル空港 / Yirol Airport | HSYL | --- | なし |
| ワラブ州 | ゴグリアル | ゴグリアル空港 / Gogrial Airport | HSGO | --- | なし |
| トンジ | トンジ空港 / Tonj Airport | HSTO | --- | なし |
| 西エクアトリア州 | ヤンビオ | ヤンビオ空港 / Yambio Airport | HSYA | --- | なし |
| トゥンブラ | トゥンブラ空港 / Tumbura Airport | HSTU | --- | なし |
| マリーディー | マリーディー空港 / Maridi Airport | HSMD | --- | なし |
| 西バハル・アル・ガザール州 | ワーウ | ワーウ空港 / Wau Airport | HSWW | WUU | なし |
| ラーガ | ラーガ空港 / Raga Airport | HSRJ | --- | なし |
| 東エクアトリア州 | トリット | トリット空港 / Torit Airport | HSTR | --- | なし |
| カポエタ | カポエタ空港 / Kapoeta Airport | HSKP | --- | なし |
| ニミュール | ニミュール空港 / Nimule Airport | HSNM | --- | なし |
| 北バハル・アル・ガザール州 | アウェル | アウェル空港 / Aweil Airport | HSAW | --- | なし |